1. Принятие участия в выработке мероприятий по исполнению государственной политики в сфере морского транспорта на территории Сахалинской области. 2. Принятие участия в разработке проектов нормативно-правовых актов по вопросам регулирования деятельности морского транспорта в соответствии с российским законодательством и законодательством Сахалинской области. 3. Взаимодействие с федеральными территориальными структурами в сфере речного и морского транспорта, предприятиями водного транспорта различных форм собственности, осуществляющих на территории Сахалинской области свою хозяйственную деятельность. 4. Участие в разработке предложений к транспортной стратегии и стратегии развития водного транспорта Сахалинской области, а также предложений по их корректировке в области морского транспорта. 5. Участие в выработке государственной инновационной политики на морском транспорте. 6. Сопровождение реализации в интересах Сахалинской области проектов в сфере морского транспорта 7. Участие в реализации федеральных и межотраслевых научно-технических программ, и инновационных проектов. 8. Выполнение текущей работы отдела морского транспорта. 9. Осуществление взаимодействия с федеральными органами государственной власти Российской Федерации, органами государственной власти субъектов Российской Федерации и местного самоуправления с предприятиями и организациями по вопросам, относящимся к компетенции отдела. 10. Принятия участие в мероприятиях, проводимых Министерством, Правительством Сахалинской области в рамках компетенции отдела. 11. Разработка проектов нормативных документов, договоров, контрактов, приказов, распоряжений, регламентов, изменений в устав учреждения по вопросам, входящим в компетенцию отдела. 12. Ведение отчетности, подготовка информационно-справочных и презентационных материалов по вопросам, входящим в компетенцию отдела.